2004年 11月 旧ナガオカより石油精製および石油化学プラント用のスクリーンを使った内部装置「インターナル」の製造販売（1975年開始）、取水用スクリーンの製造販売（1980年開始）およびケミカルレス水処理装置（現「ケミレス」）の製造販売（1997年開始）に係る資産等を譲り受けて事業を開始。
2005年 3月 本社を大阪府泉大津市に移転。
2005年 4月 特定建設業者として大阪府知事（特-17）第124081号を受ける。
2006年 3月 工場を大阪府貝塚市に新設。ISO 9001の認証取得を受ける。
2012年 4月 中華人民共和国大連市に那賀日造設備（大連）有限公司（現 那賀設備（大連）有限公司）を設立。
2014年 7月 開発センターを大阪府貝塚市に設立。
2015年 6月 東京証券取引所JASDAQスタンダード市場（現 東京証券取引所 スタンダード市場）上場。
2017年 6月 株式会社ハマダを割当先とする第三者割当増資により、同社が親会社となる。
2017年 10月 工場を兵庫県姫路市に移転。
2018年 7月 本社を大阪市中央区に移転。
2018年 8月 那賀日造設備（大連）有限公司を完全子会社化し、那賀設備（大連）有限公司に社名変更。
2020年 3月 ベトナム社会主義共和国フンイエン省にNagaoka Vietnam Co.,Ltdを設立。
2022年 7月 矢澤フェロマイト株式会社の全株式を取得し、子会社化となる。
2024年 6月 東京本社を東京都港区に設置、東京営業所を東京本社へ移転後吸収。